मोहम्मद अली जौहर यूनिवर्सिटी की स्थापना साल 2006 में उत्तर प्रदेश विधानसभा के एक क़ानून के तहत हुई थी. यह यूनिवर्सिटी आज़म खान की महत्वाकांक्षी परियोजनाओं में शामिल रही है.